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HPTⅡ基因(新霉素磷酸转移酶基因)主要来源于大肠杆菌Tn5转座子的基因，其广泛用作双子叶植物转基因的选择标记基因，对茄科植物如烟草、马铃薯和番茄等特别有效。在水稻、玉米、小麦及甘蔗等作物中也得到了成功的应用[8]。
本次研究以水稻品系为试验材料，采用定性及定量PCR方法检测水稻是否含有外源转基因成分。
2 材料与方法
2.1 材料
阳性质粒DNA (含有HPTⅡ基因），待测样品为水稻颗粒均有由老师提供。
2.2 试剂与耗材
DNA抽提试剂盒、定性PCR用Taq酶、dNTP、MgCl2、定量PCR用2x GoldStar TapMan Mixture(with ROX)、电泳用DNA ladder maker均由康为世纪公司提供。定性及定量PCR引物、探针均由上海捷瑞生物工程有限公司合成。
2.3 仪器设备
PCR扩增仪、实时荧光PCR扩增仪、电泳槽和电泳仪等电泳装置、凝胶成像系统等。
2.4 方法
2.4.1 DNA的提取与纯化
实验步骤如下：
1）将水稻颗粒使用美的搅拌机（MJ-BL25B2）粉碎成粉末状，称取 0. 2 g粉末装入液氮预冷的2mL离心管中，加入400μl Buffer GF1和4μlRNaseA(100mg/ml)，涡旋振荡1分钟，使其充分裂解。
2）65℃孵育10分钟，期间涡旋混匀2~3次。
3）加入130μl Buffer GF2，混匀，冰上孵育5分钟。
4）将所得液体转移到已装入收集管的过滤柱中，14000rpm离心2分钟，收集滤液。
5）将收集管中收集到的滤液转移到一个新离心管中。
6）加入1.5倍体积的Buffer GF3 (使用前检查是否已加入无水乙醇），充分混匀。
7）将步骤6中所得溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱中，若一次不能加完 溶液，可多次转入，10000rmp离心1分钟，倒掉收集管中的废液，将吸附柱重新放入收集管中。
8）向吸附柱中加入500μl Buffer GW（使用前检查是否已加入无水乙醇），10000rpm 离心1分钟，倒掉收集管中的废液，将吸附柱重新放回收集管中。
9）重复步骤8。
10）12000rpm离心2分钟，倒掉收集管中的废液，将吸附柱置于室温数分钟，以彻底晾干。
11）将吸附柱放到一个新离心管中，向吸附膜的中间部位悬空滴加50~100μl Buffer GE或灭菌水，室温放置2-5分钟，10000rpm离心1分钟，收集DNA溶液。-20℃保存DNA。