1、克隆拟南芥中BIO同源基因At4g32295和At3g24150,并利用pCAMBIA13011载体构建过表达载体。
2、将拟南芥同源基因At3g24150与At4g32295的过表达载体通过根癌农杆菌介导法转化拟南芥,筛选转基因植株,获取纯合后代。
3、检测转基因植株的表型变化,观察其与野生型的表型差异。以期分析并阐述其基因功能。
2 转百脉根BIO同源基因拟南芥的生长以及表型分析
拟南芥中编号为At4g32295和At3g24150的基因碱基序列与百脉根BIO基因相似性较高,其中At4g32295有2个转录本,分别是At4g32295.1和At4g32295.2。以野生型拟南芥Columbia-0生态型作为实验材料,设计相应引物分别克隆拟南芥At4g32295.1、At4g32295.2、At3g24150基因,并构建相应的过表达载体35S:At4g32295.1、35S:At4g32295.2、35S:At3g24150。
2.1 材料与试剂
2.1.1 材料和菌株
Columbia-0生态型拟南芥,种植于光照培养室,16h光照/8h黑暗,湿度70%,温度22℃;
大肠杆菌菌株DH5α和农杆菌菌株GV3101。
2.1.2 主要试剂
限制性核酸内切酶、Trizol、DNaseⅠ、RNase抑制剂、T4连接酶、Premix Taq、Maker、氨苄青霉素、卡那霉素、头孢霉素、引物等。
2.1.3 主要仪器
高速台式冷冻离心机、电泳仪、自动凝胶成像系统、恒温水浴锅、PCR扩增仪、控温摇床、超净台、-70℃超低温冰箱等。
2.2 实验方法
2.2.1 基因克隆
2.2.1.1 Trizol法提取拟南芥Total RNA
(1) 用浓度为75%的消毒酒精擦拭实验台面、移液枪、离心管架、保温瓶等器具,准备各种用具和试剂。
(2) 取0.5g~1g左右的新鲜拟南芥组织放入灭菌后的研磨小玻璃管中,研磨至破碎,再加入0.5g~1g组织/ml的Trizol试剂,研磨均匀,再倒入预冷的1.5ml离心管中,上下剧烈振摇3min及以上,室温静置5min及以上,以4℃,12000rpm的设置离心10min。
(3) 吸取上清液至1.5ml的新离心管,加入200μl的氯仿,上下剧烈振摇3min,室温放置至分层,再以4℃,12000rpm的设置离心10min。重复(3)操作一次。
(4) 吸取上清液,加入500μl预冷的异丙醇,混合均匀,室温下静置5-10min,以4℃,12000rpm的设置离心10min,弃上清。
(5) 加入1ml浓度为75%的乙醇溶液,轻柔振荡离心管,悬浮沉淀,再以4℃,12000rpm离心5min,室温下晾干至半透明状。
(6) 加入20-50μl的DEPC-H2O溶解沉淀,60℃恒温水浴10min,取1μl样液检测RNA样品浓度和纯度,另取3μl样液电泳,检测RNA样品的完整性。
(7) 冻存于-70℃超低温冰箱。
2.2.1.2 RNA逆转录合成cDNA
使用SuperRT cDNA Kit,步骤如下:
(1) 将dNTP Mix、Primer Mix、RNA Template、RT Buffer、DTT、HiFi-MMLV和RNase-Free Water溶解,置于冰上备用。