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（三）不同地域津贴、补贴差距大
虽然公务员工资制度经历了几次改革，但是很多问题还是存在，我们不难发现，在工资结构中，受财政部门控制的仅仅是公务员的基本工资，而基本工资又恰巧是在政府部门的统一标准下发放的，那公务员的工资差距到底体现在在哪？研究过公务员工资制度，我们很快发现，公务员的工资由基本工资、津贴、补贴和奖金构成。除去公务员相持平的基本工资，剩下的就还有津贴补贴和奖金了，公务员工资水平的差距主要在哪就不得而知了。
我国各地在考虑了当地财政和市场发展的情况下开始出现各自单独设立“津贴补贴”的政策的现象，这在一定程度上给公务员工资管理造成了很多不必要的麻烦。当前，各地区在津贴、补贴和奖金的发放上很大方，数量不断增加，名称五花八门，在这种情形下，不同的区域以及不同的政府部门之间的收入差距就不断扩大，地域好经济发展速度快的地区，公务员的工资待遇明显好于那些处在偏远地区的、经济发展落后的地区。对于这些问题我国又恰好缺乏统一的规划和管理，在这种情况下可以清晰地看出公务员获得高收入的主要来源不是基本工资，而是不同种类和数量的津贴和补贴。地域差异导致公务员工作的职位性质一致工资待遇却大相径庭，对于那些工作和生活在山区的公务员们却得不到与辛勤劳动相对应的报酬，公务员的心理不平衡感就会日积月累，逐渐产生懒惰心理，选择消极工作，散漫度日，公务员工资制度也就慢慢的失去了激励的作用。
（四）官本位倾向严重
如今，官本位现象的存在严重影响着我国公务员工资制度的科学合理性。我们都知道任何一个企业单位管理者都要比员工少很多，公务员也不例外，科级以上的公务员数量少，科级以下的又很多，这就形成了“物以稀为贵”的局面，职位低层级低的公务员工资收入偏低，竞争空间也小，很难再往上一级发展，而职位高层级高的公务员工资收入高，发展空间大，很容易形成官大钱多，官小钱少的现象。在官本位因素影响下的公务员工资制度，我们看不出每个公务员之间的能力差距，形成了公务员工资的划分与工作表现和绩效无关，而是直接与他们的职位相挂钩，即职位越高工资越多，职位越低的工资收入越少的现象。由此可见，官本位现象是工资制度中重视公务员的职位而不是能力的结果，在这种情形之下，贪污腐败的现象就会蔓延，危害社会，危害政府。
三、我国公务员工资制度存在问题的原因
公务员工资制度存在问题就必然有原因，只有充分了解了我国公务员工资制度问题所存在的原因，才能够更进一步提出改进的对策来不断完善它，从而更有效的发挥公务员工资制度的激励作用，增加部门公务员之间的竞争力度。对于上面提到的公务员工资制度存在的问题，笔者认为主要有下面几个原因：
（一）工资制度与经济发展不相适应
改革开放以前，我国公务员的工资水平和标准都是参照企业的模式来实行的，在这种情况下公务员工资水平就严重的与当时的经济发展水平不协调，但在改革之后，市场经济条件下的国家集中分配工资的体制也在慢慢瓦解，逐步改变了在计划经济条件下公务员的收入增长程度与社会经济增长程度脱节的事实。虽然经过了几次改革之后，公务员的工资水平有了显著的提高，但是在经济快速发展的时代，我国公务员的平均工资水平仍然处在一个比较低的层级上面，且工资水平就不能真实的反映出公务员的工作能力和自身价值。