菜单
  
    体积

    模板 2μL

    dNTPs 1μL

    10×Taq酶缓冲液 2.5μL

    TaqDNA聚合酶 0.4μL

    上游引物 1μL

    下游引物 1μL

    无菌三蒸水 17.1μL

    采用2%琼脂糖凝胶对扩增后的全部产物进行电泳检测,将胶上荧光条带小心切下放入干净离心管中并称重,按照相应比例向管内加入溶胶液,待其完全溶解后利用AxyPrepDNA凝胶回收试剂盒进行回收。

    样本测序部分由上海凌恩生物完成,最后得到测序数据。 

    1.2.3序列优化与物种组成分析

         根据overlap关系对经高通量测序得到的PE reads进行拼接,再使用软件Trimmomatic和FLASH对序列质量和拼接效果进行质控和过滤,得到最终优化序列并将其与Unite的真菌数据库进行比对,以ITS基因序列相似度97%为依据划分为不同的分类单元(OTU)。使用mothur软件进行OTU聚类分析并构建稀疏曲线,根据数据库中的参考序列对OTU进行种属鉴定和分类学分析。

  1. 上一篇:高温胁迫对大豆幼苗叶片渗透调节物质的影响研究
  2. 下一篇:牛蒡榨菜腌制初期优势嗜盐细菌耐盐特性研究
  1. 一株内生真菌的抑菌活性研究

  2. 从干牛粪中筛选纤维素降解真菌

  3. 一株产木质纤维素酶多孔真菌酶活的研究

  4. 一种芽孢杆菌属微生物的分离和抗真菌作用

  5. 浙麦冬致病真菌的分离与鉴定

  6. 一株冬青内生真菌的分离...

  7. 花生内生真菌的分离纯化...

  8. 酸性水汽提装置总汽提塔设计+CAD图纸

  9. 当代大学生慈善意识研究+文献综述

  10. 乳业同业并购式全产业链...

  11. 杂拟谷盗体内共生菌沃尔...

  12. 大众媒体对公共政策制定的影响

  13. 电站锅炉暖风器设计任务书

  14. 河岸冲刷和泥沙淤积的监测国内外研究现状

  15. 中考体育项目与体育教学合理结合的研究

  16. 十二层带中心支撑钢结构...

  17. java+mysql车辆管理系统的设计+源代码

  

About

751论文网手机版...

主页:http://www.751com.cn

关闭返回