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2.5.2对具有多个poly（A）位点的功能聚类14
2.5.3对具有多个可变起始位点的功能聚类15
2.5.4衰老相关基因新的APA位点与转录起始位点耦联关系例证15
3讨论 16
3.1三代测序现状讨论 16
3.1生物信息分析结果讨论 17
致谢17
参考文献18
细胞衰老中可变剪接与选择性多聚腺苷酸化的耦联关系研究
细胞衰老是指当细胞经历潜在的致癌应激时发生的细胞增殖（生长）上不可逆的停滞[1]。细胞衰老是一个重要的生物学过程，是个体衰老的基础，并且是一种重要的抗癌机制。在细胞衰老的过程中，伴随着一系列的生理生化过程，基因的表达也发生着剧烈的变化，包括转录层面的调控以及转录后调控[2]。而可变剪接（Alternative Splicing，AS）和选择性多聚腺苷酸化（Alternative Polyadenylation，APA）都是转录过程中的重要调控机制，它们的特殊功能影响着转录组和蛋白质组的多样性[3]。AS通过选择不同的剪接位点来导致外显子和内含子的跳跃和保留，而APA则通过对3′末端进行选择性的剪接和多聚腺苷酸化，生成不同的3′末端[4]。经报道，有超过90%的转录本在成熟的过程中会受到这两者的调控[5]。
有研究表明，人类基因组中超过半数的基因拥有多个APA位点[6]，即选择性多聚腺苷酸化广泛存在于人类基因组中，提高了转录组和蛋白质组的多样性。而APA分为两种类型（如图1所示）：当APA位点在内含子或者外显子上面时，会使3′末端的外显子产生缺失，从而生成具有不同C端结构域的蛋白质，这种类型的APA叫做编码区APA（coding region-APA ，CR-APA）[7]；另外一种情况下，APA的位点在3′末端的非翻译区（3′untranslated region ，3′UTR）上，生成的转录本具有不一样的3′UTR，但是编码相同的蛋白质，这种类型的APA叫做3′末端的非翻译区APA（UTR-APA）。
而至少90%的人类基因会经历可变剪接，且每个基因至少产生四个变体[8]。可变剪接可以通过生成不同的RNA亚型，从而提高蛋白质的多样性