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细胞色素bc1/b6f 复合体的功能之一，就是负责电子在两个氧化还原载体之间的传递，即将电子从低电势的氢醌传递到高电势的细胞色素c或质体蓝素。与此同时，电子的传递伴随着质子的跨膜运动，从而建立起跨膜的质子动力势[13]。跨膜的场所随反应类型而有所区别：植物光合作用跨膜在叶绿体类囊膜上，细菌光合作用跨膜在质膜上，呼吸作用跨膜发生在线粒体内膜上[14]。细胞色素bc1/b6f 复合体在电子传递链中的重要功能决定了它的重要研究价值，特别是近年来新发现的新型电子传递膜蛋白复合体ACⅢ是如何替代细胞色素bc1/b6f 复合体在光合电子传递链和呼吸电子传递链中行使功能的，引起了人们的广泛关注。
1.2.2 ACⅢ蛋白复合体
ACⅢ是一个多亚基的膜蛋白复合体，它含有6-7个亚基，含有22个跨膜螺旋、铁硫簇、c型亚铁血红素和醌氧化位点，是一种近年来刚被确认的蛋白质家族，被推测是细胞色素bc1或b6f复合体的功能替代物，具有醌类：电子受体氧化还原酶活性，在光合电子传递链和呼吸电子传递链中发挥着重要功能。
已经有研究证实ACⅢ蛋白复合体存在于两种细菌中：一种是不产氧光合细菌Chloroflexus aurantiacus的光合作用电子传递链中，另一种是需氧细菌Rhodothermus Marinus的呼吸电子传递链中。
1.2.3 ACⅢ的亚基组成
ACⅢ是典型的膜内蛋白复合体，早期研究认为ACⅢ包含5~7个亚基，亚基依次命名ActA、ActB、ActC、ActD、ActE、ActF、ActG。其中ActE亚基含有两个，其余亚基每种各含一个。不同细菌的ACⅢ复合体亚基组成不尽相同，但同种细菌由同一启动子编码，基因依次命名actA、actB、actC、actD、actE、actF、actG。研究还发现ACⅢ的基因主要存在于那些不含编码细胞色素bc1/b6f 复合体基因的物种中。
本研究中的光合玫瑰菌Roseiflexus castenholzii的ACⅢ蛋白复合体，从基因组分析得知它由6个亚基组成，分别由6个基因编码，可能组成一个操纵子，如图1.2所示（图中每种颜色代表一种亚基）。不产氧光合细菌Chloroflexus aurantiacus和需氧细菌Rhodothermus marinus则都由7个亚基组成。