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摘要：随着基因组测序的不断发展，基因分子生物学研究领域的重点已逐渐从功能基因转到启动子顺式作用元件和转录因子及其调控机理上。COB基因编码一种胞外糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚定蛋白，对植物的COB转录因子的探究对植物的形态形成与功能发生有重要的作用。本研究从陆生植物的不同类群中分别选择其代表物种，分析COB基因在陆生植物中的进化过程中发生了特异性扩增，该蛋白保守基序和COB转录因子蛋白的功能结构域比对分析发现相同蛋白结构域所对应的不同基序区，通过辨别植株中COB基因分布判断该蛋白功能特点。该研究从基因水平讨论了植物COB转录因子的调节机理，对植物形态学的研究以及提供了新的研究方向，也为植物COB基因进一步研究提供基础。39168
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毕业论文关键词：植物；COB基因；转录因子；进化特征
Molecular Identification and Evolutionary Features of the COB Transcription Factors in Plants
Abstract：With the development of genome sequencing, genetic and molecular biology research focus has been gradually shifted from the field of functional genomics to the promoter cis-acting elements and transcription factors and their regulatory mechanism. COB gene encodes an extracellular glycosyl phosphatidylinositol (GPI) anchored proteins, transcription factors plant for COB inquiry form on plant morphology and function has an important role. In this study, from different groups of terrestrial plants, respectively chosen its representative species-specific amplification COB analyze gene evolution in terrestrial plants occurs, the conserved motifs and COB protein transcription factor protein functional domains ratio analysis found that the same protein domains corresponding to different motif region, by identifying plants COB gene determining the distribution of the protein features. The study discusses the regulatory mechanisms of gene level COB transcription factors on plant morphology studies, not only provide a new direction, but also provide a basis for COB genes further study of plant.
Key words: Plant, COB gene, Transcription factor, Evolutionary feature
目 录
摘要 3
引言 4
1数据与方法 5
1.1序列检索与下载 5
1.2序列比对与系统进化分析 5
1.3蛋白保守基序组成模式分析 6
1.4 基因的表达分析 6
2 结果与分析 6
2.1 植物COB转录因子基因的鉴定 6
2.2 植物COB转录因子基因的系统进化关系 8
2.3 植物COB转录因子蛋白的保守基序组成模式 9
2.4 植物COB转录因子蛋白的功能结构域 11
2.5 拟南芥与水稻COB转录因子基因的表达谱 12
3 讨论与结论 15
参考文献 16
致谢 18
植物COB转录因子的鉴定与分子进化特征引言
转录因子(Transcription factor)是指能与某基因上游的特异核苷酸序列共价结合的蛋白质。植物转录因子通过其功能域与DNA及其他蛋白间的相互作用，激活或抑制诱导基因的表达[1]。近年来，基因分子生物学研究领域的重点，已逐渐从功能基因转到启动子顺式作用元件和转录因子及其调控机理上。对转录因子的结构与功能的分析鉴定，是阐明在各种条件下基因表达调控机理的重要内容之一，揭示转录因子之间以及它们与DNA之间相互作用的具体机制，就可以人为的控制特定基因的表达，使植物基因转化能获得好的结果[1]。植物细胞最终的尺寸与形状是细胞分裂和细胞扩增协同表达的结果。现在普遍认为，细胞的扩展方向是由纤文素微纤丝的定向发展所控制的，在参与到纤文素的合成和堆积的许多基因中，COB基因通过调节纤文素微纤丝在植物形态中的定向发生，而在各向异性扩展中起着至关重要的作用[2]。COB基因编码一种胞外糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚定蛋白(GAP)，是细胞壁的合成和形态发生所必须的[3]。