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拮抗作用：木霉菌通过产生小分子的抗生素和大分子的抗菌蛋白或胞壁降解酶类来抑制病原菌的生长、繁殖和侵染。木霉菌在抗生和菌寄生中，可产生几丁质酶、纤文素酶和蛋白酶来分解植物病原真菌的细胞壁或分泌葡萄糖苷酶等胞外酶来降解病原菌产生的抗生毒素[3]。同时，木霉菌还分泌抗菌蛋白或裂解酶来抑制植物病原真菌的侵染[4]。
竞争作用：木霉菌可以通过快速生长和繁殖而夺取水分和养分、占有空间、消耗氧气等，以至削弱和排除同一生境中的灰霉病病原物。
重寄生作用：研究发现木霉菌会在特定环境里进入寄主菌丝后形成大量的分枝和有性结构，大致分为四个步骤：首先；趋化性生长，即木霉菌可以趋向可以产生化学刺激的激物病原物生长。第二步是识别，此步骤和病原菌所含的聚血素及拮抗菌表面拥有的碳水化合物接收器有关，它左右了病原菌与拮抗微生物之间作用的专一性。第三步，接触与细胞壁分解。第四部，穿刺作用，即木霉可以产生类似附着器的构造，从而侵入真菌细胞，来分解并利用病原菌细胞物质。
促生作用：研究人员发现，木霉在使用的过程中，不仅能控制植物灰霉病的发生，而且能增加种子的萌发率、根和苗的长度以及植株的活力[5]。
诱导抗性：木霉能诱导寄主植物产生防御反应，不仅能直接抑制灰葡萄孢的生长和繁殖，而且还能诱导作物产生自我防御系统，从而获得抗病性。
木霉能够提高土壤含水量，通过木霉的使用能够减少植物叶片中丙二醛的含量，提高盐胁迫下植物次生代谢产物含量从而达到提高植物耐盐胁迫能力的目标[6]。哈茨木霉可以通过提高NO水平缓解椒样薄荷NaCl胁迫的过程从而提高了教养薄荷的耐盐能力[7]。
目前，传统农药以及化学药剂的大量使用对环境污染和生态的破坏日趋严重，随着人民的生活水平不断提高，人们越来越重视生态环境，怎样减少化学农药的使用、消除环境中的农药化学物质的残留，成为各国的研究重点，生物防治业迅速发展起来，因此，木霉能够诱导植物对逆境产生抗性的研究，对于人类的可持续发展具有重要意义[8]。
土壤环境盐渍化：盐胁迫对植物生长发育最普遍和最显著的效应就是抑制植物生长发育，具体表现为植株矮小和产量降低。研究表明；盐胁迫下，NaCl 会对植物的生长发育产生显著影响，盐胁迫对于植物的生理生化的影响具体可总结为以下几点：盐胁迫对植物生长发育、代谢、光合作用、呼吸作用、蛋白质合成的影响等[9]。但是，目前关于盐胁迫对植物生长发育的影响的生理机制的研究还没有一致的结论。
盐胁迫主要从以下三个方面影响植物的生长发育：第一点：盐胁迫条件下的低水势是影响植物多种生理生化过程的根本原因，低水势会引起植物叶片水势下降，进而导致气孔导度下降；第二点：盐胁迫使光合作用速率降低，减少了植物自身能量和同化物的供给，从而限制植物的生长发育；第三点：盐胁迫会影响某些特定的酶或代谢过程，从而影响植物的生长发育[10]。在盐胁迫情况下，植物细胞内会积累过量的Na+、Cl－等离子，引起植物体内各种生理生化的变化，导致植物体代谢紊乱，造成对植物的离子毒害以及活性氧的伤害，从而严重影响植物生长发育，甚至死亡[11]。
随着社会快速发展，同时也伴随着一些负面影响，工厂等大型企业排放，以及农作物应用化学药剂，导致植物生长环境中土壤的成分改变，盐碱地增多，使植物的生长环境逐渐恶化，土壤盐渍化则是影响植物生长逆境的主要因素之一[12]。
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