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油菜遗传育种和杂交种生产中,需要鉴定细胞质的类型。基于基因组序列研究表明,叶绿体基因组差别不大,而线粒体基因组差别较大,因此主要可以通过线粒体基因组的特异序列鉴定细胞质类型。
总结起来,细胞质类型的鉴定方法主要包括:
(1)线粒体基因组测序:主要包括传统的DNA测序方法,如Sanger提出的双脱氧测定法、逐步克隆测定法和基因组鸟枪法等;新一代DNA测序方法,如循环芯片测序法、Solexa测序法和焦磷酸测序法等 [12],但上述线粒体基因组测序的方法过程复杂,成本过高,不易掌握;
(2)恢-保关系鉴定方法:取各种来源不同的植株作为测交父本,同时取其上花粉对待测的植株进行测交,至第二年收获测交一代并将其播种,在测交一代的各个生长阶段进行观察,于开花期调查其育性,将所观察的育性情况进行记录,与育性分级标准比对后确定测交一代育性,从而确定细胞质类型[13]。本方法可以准确有效鉴定细胞质类型,但是鉴定恢-保关系耗时过长,且成本过高,不易采用 ;
(3)标记鉴定方法:通过以线粒体基因上的特异序列,设计引物,通过PCR方法,理论上可以鉴别细胞质类型。
本研究尝试采用PCR鉴定方法,鉴定细胞质。通过提取油菜DNA,依据不同细胞质mtDNA的特异序列,设计引物,采用PCR方法扩增DNA片段,从而鉴定细胞质类型,研究通过PCR方法鉴定细胞质类型的方法。
1 材料与方法
1.1 实验材料
本实验的材料取自南京油菜遗传育种实验室,名称见表1。
本实验所用的仪器包括光照培养箱、低温冷冻离心机Eppendorf、恒温水浴锅、-20℃冰箱来自南京农业大学油菜遗传育种实验室;容量离心机、高速离心机、超速离心机来自南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室。
本实验所用的试剂有DNase I购自于Roche;蛋白酶K和RNase A购于sigma公司;其它试剂购自于生兴有限公司。
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