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近年来，西方国家对农药残留指标要求越来越高，而我国在农药管理和使用方面不是特别规范，使我国农畜产品遭受国外的贸易壁垒越来越多，因为农药残留超标引起的农畜产品撤销出口事件越来越多，使农副产品的国际贸易额大幅度减少。
1.2.1土壤农药的化学降解
进入土壤中的农药在有氧或无氧的情况下就会发生氧化．还原反应，例如，特丁磷、甲拌磷、异丙胺磷和涕灭威在土壤氧气充足时可以很快氧化：对硫磷、杀螟磷、氯硝醚在厌氧条件下能很快发生分解。农药的氧化-还原反应是与土壤中的氧化还原电位密切相关的。当土壤透气性好时．其Eh高，有利于氧化反应进行，反之则利于还原反应进行。
土壤的组分对于农药的化学降解有着直接的影响，农药在各种不同的土壤中的降解速率各不相同．这在许多文献中也已有报道。土壤含水量的多少影响了土壤的透气性能，进而影响了土壤中的氧化还原电位的大小。从而决定了农药化学降解的快慢。徐瑞薇等也证实好氧条件下有利于杀虫双的降解，厌氧条件下则不利于它的降解。
1.2.2土壤农药的光解
由于农药中一般含有C-C、C-H．C-O、C-N等键。而这些键的离解正好在太阳光的波长范围内。因此农药在吸收光予之后，就变成为激发态朗分子，导致上述等键的断裂，发生光解反应。
同种农药在不同光波跃下降解的程度是不相同的。刘文屏等研究发现，绿草定在254nm波长处有较快的降解，而在300 nm波长下降解速率只是前者的1/3。郑巍指出普杀特在紫外光照射下易分解，而在可见光区降解则较难进行。
各种农药对光化学反应的敏感性说明，光解对于降解土壤中的农药有着重要作用，在农药光解的初期阶段，农药分子分裂成不稳定的游离基，它可与溶剂、其它农药分子和其它反应物发生连锁反应，因此，光化学反应可能是异构化、取代作用和氧化作用的合成结果。
1.2.3土壤农药的水解
有农药可能会发生水解，Horrobin和Russel提出了阿特拉津吸附催化水解模式，指出氢键可以有相似于H离子催化氯化均三氮杂苯水解的机制来催化水解环上与氯原子结合的碳原子被负电性的氯和氮原子包围着，因而易受OH的影响而水解。它主要有两种类型，一种是农药在土壤中由酸催化或碱催化的反应：另一种是由于粘土的吸附催化作用而发生的反应。
1.2.4土壤农药的微生物降解
农药的微生物降解作用实际上是酶促反应，大多数农药的微生物降解途径已经明了。综合来说，农药的微生物降解的途径包括氧化、还原、水解、脱卤缩合、脱羧、异构化等。微生物降解是一些农药在土壤中的迁移转化的主要方式如：DDT、对硫磷、艾氏剂等的主要消失途径是通过微生物降解。影响微生物降解的主要条件是温度、微生物的菌属、土壤的含水量、有机物含量。
温度影响微生物降解的速度主要是因为温度影响了微生物的活性，从而影响了降解速度。土壤的含水量、有机物含量、微生物的组成可能极大地改变了微生物降解速度。例如，二嗪农在厌氧条件下(水淹)的土壤中能很快的被降解，可能是由于降解二嚎农的细菌属(如节细菌属、黄杆菌属、链霉属等)是属于厌氧菌，在水淹条件下能大量繁殖，从而加速了二嗪农的微生物降解。土壤水中的有机碳浓度影响着微生物的生长，有机碳的浓度越高，则残留除草剂的降解越易。土壤中的含水量的增加也能使微生物的生长加快，从而也加快了农药微生物降解的速率。
1.2.5土壤农药的扩散
农药在土壤中的扩散有两种形式：一种是由于农药分子的不规则运动而使农药迁移的过程而另一种则是由于外力发生的结果。土壤中的农药在流动水或在重力作用下向下渗滤，并在土壤中逐层分布。后一种形式是土壤中农药扩散的主要模式；这个过程与吸附、降解和挥发等过程密切相关。